Die Universität Basel hat die zwei Profilierungsbereiche Leben (Life Sciences) und Kultur (Kulturwissenschaften) definiert. Innerhalb dieser Bereiche sind die Prioritäten in mehrere Hierarchiestufen gegliedert. Die Forschungspyramide umfasst:

• Nationale Forschungsschwerpunkte (NFS) (National Centers of Competence in Research, NCCR)
• Universitäre Forschungsschwerpunkte
• Kompetenzzentren
• Fakultäre Forschungsschwerpunkte
• Individuelle freie Forschung